В октябре 1941 г. в связи с началом войны было принято решение об эвакуации части Союзного Московского прожекторного завода в Новосибирск.
В начале ноября 1941 г. первые железнодорожные эшелоны прибыли в Новосибирск. Пятьсот рабочих во главе с директором Ароном Львовичем Эстриным с привезенным оборудованием и документацией уже через месяц, 14 декабря, практически под открытым небом начали выпуск продукции: были изготовлены первые детали и узлы для комплектации боеприпасов и военной техники. Так началась история завода на сибирской земле.
В 1941-1945 годах за выполнение заказов по поставке военной продукции коллектив завода многократно награждался переходящим Красным знаменем Государственного Комитета Обороны.
После войны предприятие продолжило выпуск оборонной продукции. Вместе с тем увеличился объем выпуска товаров гражданского назначения.
В 1956 году осуществилась первая экспортная поставка. В одном только 1968 году на экспорт были поставлены изделия стоимостью 2,6 млн. долларов. В 70-е годы продукция поставлялась на экспорт уже в 32 страны.
Своё нынешнее название завод получил в 1974 году. 16 апреля 1974 года по приказу министра образовалось Новосибирское производственное электротранспортное объединение «Электроагрегат».
Теперь, кроме основной продукции – автономных электростанций и засекреченных военных заказов – на предприятии начали производить товары народного потребления. В это время номенклатура насчитывала свыше 200 наименований.
В 80-х годах началась модернизация продукции на основе элементной базы. Освоены высоконадежные программируемые контроллеры для ракетного комплекса железнодорожного базирования. Выпускаются десятки модификаций дизель-электростанций и агрегатов мощностью от 10 до 200 кВт, различные типы наземных источников электроснабжения для запуска летательных аппаратов. Кроме того, на «Электроагрегате» производят игрушки и товары народного потребления.
В 90-е годы под влиянием рыночной экономики меняется номенклатура, технология и организация производства. В 1993 году завод преобразуется в открытое акционерное общество «Электроагрегат». Вновь появляются заказы на профилирующие изделия – передвижные электростанции и электроагрегаты малой энергетики, которые используются в полевых условиях чеченской войны. Источники резервного питания находят все большее применение в гражданской сфере электроснабжения объектов первостепенной важности: лечебные учреждения, банковская структура, предприятия с непрерывным циклом производства, системы жизнеобеспечения. Осваивается выпуск горношахтного электрооборудования.
В 2000-е годы значительные преобразования в структуре управления, подготовки и организации производства, концентрации ресурсов, проведения антикризисных мер позволяют вывести предприятие на новый уровень развития с выходом на стабильный и эффективный уровень технико-экономических показателей.
В настоящее время завод сотрудничает с Министерством обороны, Министерством внутренних дел, Федеральной погранслужбой, а также с предприятиями газовой и нефтяной промышленности.